Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
YOD1Q5VVQ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YOD1Q5VVQ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YOD1Q5VVQ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms