Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP9Q5VTM2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP9Q5VTM2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP9Q5VTM2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP9Q5VTM2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP9Q5VTM2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP9Q5VTM2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
AGAP9Q5VTM2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP9Q5VTM2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP9Q5VTM2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms