Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC38Q5VT99 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC38Q5VT99 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
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