Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMTC4Q5T4D3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMTC4Q5T4D3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMTC4Q5T4D3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms