Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECTD3Q5T447 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HECTD3Q5T447 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HECTD3Q5T447 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HECTD3Q5T447 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HECTD3Q5T447 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HECTD3Q5T447 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HECTD3Q5T447 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HECTD3Q5T447 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HECTD3Q5T447 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HECTD3Q5T447 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HECTD3Q5T447 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HECTD3Q5T447 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HECTD3Q5T447 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HECTD3Q5T447 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HECTD3Q5T447 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HECTD3Q5T447 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HECTD3Q5T447 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms