Protein–RNA interactions for Protein: Q5BVD1

TTMP, TPA-induced transmembrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTMPQ5BVD1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTMPQ5BVD1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTMPQ5BVD1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTMPQ5BVD1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTMPQ5BVD1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTMPQ5BVD1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTMPQ5BVD1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTMPQ5BVD1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTMPQ5BVD1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTMPQ5BVD1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTMPQ5BVD1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTMPQ5BVD1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms