Protein–RNA interactions for Protein: Q4G176

ACSF3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSF3Q4G176 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSF3Q4G176 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSF3Q4G176 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSF3Q4G176 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSF3Q4G176 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms