Protein–RNA interactions for Protein: Q494X3

ZNF404, Zinc finger protein 404, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404Q494X3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF404Q494X3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF404Q494X3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF404Q494X3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms