Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTU2Q2VPK5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTU2Q2VPK5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTU2Q2VPK5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU2Q2VPK5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms