Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HIF1AQ16665 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIF1AQ16665 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIF1AQ16665 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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