Protein–RNA interactions for Protein: Q16552

IL17A, Interleukin-17A, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL17AQ16552 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
IL17AQ16552 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IL17AQ16552 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IL17AQ16552 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IL17AQ16552 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IL17AQ16552 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IL17AQ16552 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IL17AQ16552 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IL17AQ16552 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IL17AQ16552 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IL17AQ16552 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IL17AQ16552 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IL17AQ16552 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IL17AQ16552 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IL17AQ16552 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IL17AQ16552 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IL17AQ16552 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IL17AQ16552 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IL17AQ16552 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IL17AQ16552 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IL17AQ16552 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IL17AQ16552 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IL17AQ16552 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms