Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNCBQ16143 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNCBQ16143 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNCBQ16143 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNCBQ16143 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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