Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC7Q15024 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
EXOSC7Q15024 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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