Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 PSMA3-AS1-201ENST00000551597 507 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.496e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 SUMF1-203ENST00000405420 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.496e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 PSMA3-AS1-209ENST00000555707 1983 ntTSL 1 (best)11.93□□□□□ -0.56e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 RRP1B-202ENST00000470886 4634 ntTSL 211.91□□□□□ -0.56e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 PSMA3-AS1-208ENST00000555275 903 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.516e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt11.18□□□□□ -0.626e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt11.1□□□□□ -0.636e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 PSMA3-AS1-214ENST00000557660 2360 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.646e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 LTN1-203ENST00000389195 2714 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.686e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 PSMA3-AS1-205ENST00000554378 741 ntTSL 1 (best)10.44□□□□□ -0.746e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 SPATA5-202ENST00000422835 2492 ntTSL 1 (best)10.22□□□□□ -0.776e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 PSMA3-AS1-204ENST00000554360 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.816e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 SPTLC3-204ENST00000450297 645 ntTSL 39.69□□□□□ -0.866e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.886e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 PSMA3-AS1-210ENST00000556002 1039 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.026e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.146e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 C14orf37-203ENST00000554218 572 ntTSL 47.93□□□□□ -1.146e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 SPTLC3-203ENST00000434210 572 ntTSL 37.49□□□□□ -1.216e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.276e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.89□□□□□ -1.316e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.316e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 FAM95C-202ENST00000636756 654 ntTSL 26.62□□□□□ -1.356e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 SPTLC3-205ENST00000476791 2480 ntTSL 1 (best)6.36□□□□□ -1.396e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.426e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.436e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.436e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 COG5-208ENST00000475638 592 ntTSL 36.1□□□□□ -1.433e-8■■■■□ 22
HLTFQ14527 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.476e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.496e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.536e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 PSMA3-AS1-202ENST00000553657 398 ntTSL 35.27□□□□□ -1.576e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.726e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.936e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 FAM135A-201ENST00000194672 5198 ntTSL 51.74□□□□□ -2.136e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.246e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.61e-6■■■■□ 22
HLTFQ14527 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.715e-7■■■■□ 21.9
HLTFQ14527 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.525e-7■■■■□ 21.9
HLTFQ14527 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.267e-6■■■■□ 21.9
HLTFQ14527 PLD1-216ENST00000498278 996 ntTSL 56.51□□□□□ -1.377e-6■■■■□ 21.9
HLTFQ14527 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.477e-6■■■■□ 21.9
HLTFQ14527 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.216e-6■■■■□ 21.9
HLTFQ14527 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -06e-6■■■■□ 21.9
HLTFQ14527 F10-204ENST00000410083 1211 ntTSL 1 (best)14.1□□□□□ -0.156e-6■■■■□ 21.9
HLTFQ14527 F10-205ENST00000477269 907 ntTSL 1 (best)13.64□□□□□ -0.236e-6■■■■□ 21.9
HLTFQ14527 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.326e-6■■■■□ 21.9
HLTFQ14527 KNL1-203ENST00000526913 5584 ntTSL 1 (best)1.68□□□□□ -2.147e-7■■■■□ 21.8
HLTFQ14527 ANKRD12-202ENST00000359158 2250 ntTSL 22.99□□□□□ -1.934e-8■■■■□ 21.8
HLTFQ14527 HECTD4-212ENST00000550724 587 ntTSL 314.37□□□□□ -0.114e-7■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.374e-7■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.34e-7■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.155e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 PIK3C3-211ENST00000589550 597 ntTSL 37.09□□□□□ -1.275e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 PIK3C3-214ENST00000591011 686 ntTSL 56.37□□□□□ -1.395e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.475e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.535e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.314e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.924e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.742e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 219.23■□□□□ 0.672e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 213.81□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.022e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 227.57■■■□□ 22e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.572e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 319.42■□□□□ 0.72e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 518.31■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 214.74□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 314.7□□□□□ -0.062e-6■■■■□ 21.7
HLTFQ14527 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 21.6
HLTFQ14527 PRH1-202ENST00000536086 554 ntTSL 56.23□□□□□ -1.418e-7■■■■□ 21.6
HLTFQ14527 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.229e-7■■■■□ 21.5
HLTFQ14527 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.492e-10■■■■□ 21.4
HLTFQ14527 PPP1R12C-209ENST00000592993 2269 ntTSL 1 (best)22.25■■□□□ 1.152e-10■■■■□ 21.4
HLTFQ14527 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.762e-7■■■■□ 21.4
HLTFQ14527 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.382e-7■■■■□ 21.4
HLTFQ14527 DHFR-205ENST00000511032 1474 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 21.4
HLTFQ14527 DHFR-206ENST00000513048 994 ntTSL 1 (best)9.56□□□□□ -0.882e-7■■■■□ 21.4
HLTFQ14527 DHFR-202ENST00000504396 1447 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.952e-7■■■■□ 21.4
HLTFQ14527 DHFR-204ENST00000508282 545 ntTSL 35.95□□□□□ -1.462e-7■■■■□ 21.4
HLTFQ14527 DHFR-207ENST00000513314 582 ntTSL 34.49□□□□□ -1.692e-7■■■■□ 21.4
HLTFQ14527 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 12e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 CYTH1-216ENST00000591574 1043 ntTSL 324.29■■□□□ 1.488e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 PIK3CB-202ENST00000461451 667 ntTSL 223.85■■□□□ 1.418e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.348e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 522.88■■□□□ 1.258e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.228e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.28e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 PIK3CB-210ENST00000483968 721 ntTSL 322.47■■□□□ 1.198e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.168e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.038e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 ZHX3-208ENST00000441102 688 ntTSL 220.92■□□□□ 0.948e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 PTK2-257ENST00000524357 535 ntTSL 420.64■□□□□ 0.898e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.888e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 CYTH1-213ENST00000590775 582 ntTSL 520.31■□□□□ 0.848e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 PTK2-218ENST00000519993 4388 ntTSL 1 (best)20.1■□□□□ 0.818e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.798e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.778e-6■■■■□ 21.3
HLTFQ14527 PIK3CB-204ENST00000462898 4747 ntTSL 519.46■□□□□ 0.718e-6■■■■□ 21.3
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