Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
UBE4AQ14139 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
UBE4AQ14139 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
UBE4AQ14139 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
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