Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SNX1Q13596 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNX1Q13596 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX1Q13596 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
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