Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK18Q07002 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK18Q07002 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK18Q07002 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK18Q07002 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms