Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLOD1Q02809 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLOD1Q02809 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLOD1Q02809 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms