Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1BQ00975 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1BQ00975 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1BQ00975 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms