Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSF1Q00613 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSF1Q00613 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HSF1Q00613 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms