Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPS35P82673 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPS35P82673 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms