Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNA1P78396 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNA1P78396 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCNA1P78396 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNA1P78396 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms