Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F2P78329 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F2P78329 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4F2P78329 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F2P78329 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4F2P78329 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4F2P78329 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms