Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTA2P62736 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTA2P62736 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTA2P62736 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTA2P62736 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms