Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPZ1P61923 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPZ1P61923 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPZ1P61923 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ1P61923 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms