Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ROMO1P60602 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ROMO1P60602 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ROMO1P60602 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms