Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AIF1P55008 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AIF1P55008 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AIF1P55008 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AIF1P55008 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AIF1P55008 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AIF1P55008 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AIF1P55008 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AIF1P55008 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AIF1P55008 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AIF1P55008 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AIF1P55008 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AIF1P55008 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AIF1P55008 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AIF1P55008 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AIF1P55008 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AIF1P55008 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
AIF1P55008 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AIF1P55008 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AIF1P55008 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AIF1P55008 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AIF1P55008 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AIF1P55008 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AIF1P55008 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
AIF1P55008 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
AIF1P55008 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AIF1P55008 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AIF1P55008 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AIF1P55008 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AIF1P55008 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AIF1P55008 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AIF1P55008 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AIF1P55008 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AIF1P55008 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AIF1P55008 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AIF1P55008 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AIF1P55008 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AIF1P55008 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AIF1P55008 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AIF1P55008 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AIF1P55008 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AIF1P55008 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AIF1P55008 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AIF1P55008 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AIF1P55008 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AIF1P55008 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AIF1P55008 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
AIF1P55008 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AIF1P55008 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AIF1P55008 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AIF1P55008 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AIF1P55008 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AIF1P55008 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AIF1P55008 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AIF1P55008 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
AIF1P55008 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
AIF1P55008 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AIF1P55008 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AIF1P55008 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AIF1P55008 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AIF1P55008 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AIF1P55008 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AIF1P55008 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AIF1P55008 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AIF1P55008 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AIF1P55008 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AIF1P55008 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AIF1P55008 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AIF1P55008 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AIF1P55008 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AIF1P55008 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AIF1P55008 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AIF1P55008 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AIF1P55008 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
AIF1P55008 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AIF1P55008 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AIF1P55008 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AIF1P55008 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AIF1P55008 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AIF1P55008 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AIF1P55008 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AIF1P55008 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AIF1P55008 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AIF1P55008 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AIF1P55008 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AIF1P55008 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AIF1P55008 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AIF1P55008 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AIF1P55008 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AIF1P55008 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AIF1P55008 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AIF1P55008 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AIF1P55008 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AIF1P55008 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AIF1P55008 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AIF1P55008 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AIF1P55008 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AIF1P55008 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AIF1P55008 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AIF1P55008 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms