Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERFP50548 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERFP50548 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ERFP50548 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERFP50548 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERFP50548 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERFP50548 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERFP50548 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERFP50548 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERFP50548 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERFP50548 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERFP50548 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERFP50548 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERFP50548 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ERFP50548 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERFP50548 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERFP50548 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERFP50548 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERFP50548 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERFP50548 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERFP50548 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERFP50548 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERFP50548 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERFP50548 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERFP50548 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ERFP50548 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERFP50548 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERFP50548 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERFP50548 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERFP50548 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERFP50548 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERFP50548 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERFP50548 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERFP50548 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERFP50548 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERFP50548 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERFP50548 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERFP50548 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERFP50548 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERFP50548 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERFP50548 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERFP50548 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERFP50548 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERFP50548 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERFP50548 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERFP50548 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERFP50548 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERFP50548 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERFP50548 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERFP50548 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERFP50548 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERFP50548 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERFP50548 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERFP50548 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERFP50548 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERFP50548 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERFP50548 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERFP50548 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERFP50548 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERFP50548 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERFP50548 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERFP50548 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERFP50548 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERFP50548 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERFP50548 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERFP50548 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERFP50548 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERFP50548 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERFP50548 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERFP50548 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERFP50548 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERFP50548 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERFP50548 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERFP50548 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERFP50548 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERFP50548 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERFP50548 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERFP50548 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERFP50548 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERFP50548 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERFP50548 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERFP50548 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERFP50548 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERFP50548 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERFP50548 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERFP50548 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERFP50548 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERFP50548 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERFP50548 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERFP50548 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERFP50548 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERFP50548 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERFP50548 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERFP50548 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERFP50548 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERFP50548 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERFP50548 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERFP50548 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERFP50548 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERFP50548 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms