Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms