Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPD2P43304 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPD2P43304 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPD2P43304 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPD2P43304 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPD2P43304 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPD2P43304 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPD2P43304 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPD2P43304 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPD2P43304 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPD2P43304 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GPD2P43304 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPD2P43304 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPD2P43304 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPD2P43304 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPD2P43304 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPD2P43304 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPD2P43304 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPD2P43304 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPD2P43304 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPD2P43304 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPD2P43304 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPD2P43304 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPD2P43304 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPD2P43304 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPD2P43304 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPD2P43304 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPD2P43304 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPD2P43304 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPD2P43304 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPD2P43304 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPD2P43304 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPD2P43304 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPD2P43304 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPD2P43304 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPD2P43304 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GPD2P43304 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPD2P43304 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPD2P43304 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPD2P43304 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPD2P43304 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPD2P43304 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPD2P43304 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPD2P43304 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPD2P43304 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPD2P43304 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPD2P43304 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPD2P43304 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPD2P43304 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPD2P43304 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GPD2P43304 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPD2P43304 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GPD2P43304 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPD2P43304 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPD2P43304 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPD2P43304 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GPD2P43304 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPD2P43304 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPD2P43304 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPD2P43304 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPD2P43304 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPD2P43304 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPD2P43304 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPD2P43304 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPD2P43304 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPD2P43304 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPD2P43304 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPD2P43304 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPD2P43304 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPD2P43304 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPD2P43304 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPD2P43304 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPD2P43304 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPD2P43304 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPD2P43304 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPD2P43304 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPD2P43304 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPD2P43304 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPD2P43304 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPD2P43304 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPD2P43304 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPD2P43304 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPD2P43304 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPD2P43304 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPD2P43304 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPD2P43304 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPD2P43304 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPD2P43304 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPD2P43304 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPD2P43304 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPD2P43304 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPD2P43304 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPD2P43304 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPD2P43304 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPD2P43304 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPD2P43304 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPD2P43304 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPD2P43304 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPD2P43304 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPD2P43304 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.4 ms