Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASRP41180 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASRP41180 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CASRP41180 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASRP41180 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASRP41180 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASRP41180 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASRP41180 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASRP41180 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASRP41180 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASRP41180 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASRP41180 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASRP41180 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASRP41180 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASRP41180 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASRP41180 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASRP41180 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASRP41180 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASRP41180 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASRP41180 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASRP41180 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASRP41180 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASRP41180 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CASRP41180 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASRP41180 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASRP41180 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CASRP41180 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASRP41180 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CASRP41180 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASRP41180 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASRP41180 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASRP41180 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASRP41180 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASRP41180 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASRP41180 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASRP41180 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASRP41180 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASRP41180 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASRP41180 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CASRP41180 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASRP41180 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CASRP41180 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASRP41180 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASRP41180 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASRP41180 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASRP41180 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASRP41180 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASRP41180 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASRP41180 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASRP41180 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASRP41180 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASRP41180 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASRP41180 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASRP41180 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASRP41180 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASRP41180 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASRP41180 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASRP41180 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASRP41180 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASRP41180 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASRP41180 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASRP41180 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASRP41180 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASRP41180 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASRP41180 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASRP41180 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASRP41180 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASRP41180 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASRP41180 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASRP41180 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASRP41180 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASRP41180 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASRP41180 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASRP41180 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASRP41180 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASRP41180 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CASRP41180 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASRP41180 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASRP41180 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASRP41180 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASRP41180 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASRP41180 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASRP41180 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASRP41180 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASRP41180 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASRP41180 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASRP41180 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASRP41180 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASRP41180 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASRP41180 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASRP41180 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASRP41180 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASRP41180 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASRP41180 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASRP41180 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASRP41180 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASRP41180 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASRP41180 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASRP41180 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CASRP41180 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms