Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHRP34981 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHRP34981 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHRP34981 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHRP34981 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHRP34981 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHRP34981 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHRP34981 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHRP34981 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHRP34981 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHRP34981 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHRP34981 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHRP34981 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHRP34981 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHRP34981 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHRP34981 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHRP34981 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHRP34981 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHRP34981 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHRP34981 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHRP34981 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHRP34981 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHRP34981 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHRP34981 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHRP34981 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHRP34981 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRHRP34981 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRHRP34981 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRHRP34981 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRHRP34981 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRHRP34981 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRHRP34981 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRHRP34981 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRHRP34981 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRHRP34981 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRHRP34981 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRHRP34981 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHRP34981 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHRP34981 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHRP34981 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHRP34981 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHRP34981 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHRP34981 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHRP34981 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHRP34981 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHRP34981 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHRP34981 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHRP34981 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHRP34981 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHRP34981 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHRP34981 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHRP34981 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHRP34981 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHRP34981 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHRP34981 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHRP34981 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHRP34981 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRHRP34981 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRHRP34981 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHRP34981 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHRP34981 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHRP34981 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHRP34981 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHRP34981 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHRP34981 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHRP34981 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHRP34981 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHRP34981 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRHRP34981 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHRP34981 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHRP34981 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHRP34981 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHRP34981 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHRP34981 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHRP34981 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRHRP34981 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHRP34981 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHRP34981 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHRP34981 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHRP34981 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRHRP34981 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHRP34981 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHRP34981 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHRP34981 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHRP34981 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHRP34981 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHRP34981 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRHRP34981 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHRP34981 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHRP34981 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHRP34981 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHRP34981 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHRP34981 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRHRP34981 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
TRHRP34981 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHRP34981 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHRP34981 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHRP34981 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHRP34981 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRHRP34981 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms