Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA6P31267 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA6P31267 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms