Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH4A1P30038 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH4A1P30038 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALDH4A1P30038 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH4A1P30038 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH4A1P30038 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH4A1P30038 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms