Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC1P29353 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC1P29353 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC1P29353 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC1P29353 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC1P29353 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC1P29353 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC1P29353 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC1P29353 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC1P29353 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC1P29353 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC1P29353 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC1P29353 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC1P29353 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC1P29353 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC1P29353 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC1P29353 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC1P29353 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC1P29353 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC1P29353 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC1P29353 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC1P29353 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC1P29353 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC1P29353 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC1P29353 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC1P29353 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC1P29353 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC1P29353 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC1P29353 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC1P29353 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC1P29353 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC1P29353 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHC1P29353 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC1P29353 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHC1P29353 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC1P29353 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC1P29353 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC1P29353 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC1P29353 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC1P29353 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHC1P29353 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC1P29353 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC1P29353 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHC1P29353 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHC1P29353 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHC1P29353 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHC1P29353 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHC1P29353 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHC1P29353 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHC1P29353 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHC1P29353 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SHC1P29353 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHC1P29353 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHC1P29353 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHC1P29353 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHC1P29353 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHC1P29353 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHC1P29353 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHC1P29353 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHC1P29353 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHC1P29353 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHC1P29353 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHC1P29353 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHC1P29353 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SHC1P29353 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHC1P29353 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHC1P29353 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHC1P29353 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHC1P29353 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHC1P29353 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHC1P29353 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHC1P29353 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHC1P29353 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHC1P29353 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHC1P29353 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHC1P29353 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHC1P29353 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHC1P29353 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHC1P29353 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHC1P29353 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHC1P29353 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHC1P29353 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHC1P29353 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHC1P29353 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHC1P29353 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHC1P29353 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHC1P29353 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHC1P29353 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHC1P29353 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHC1P29353 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHC1P29353 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHC1P29353 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHC1P29353 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHC1P29353 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHC1P29353 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHC1P29353 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHC1P29353 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHC1P29353 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHC1P29353 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHC1P29353 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms