Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR2AP28223 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR2AP28223 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms