Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HLA-DMAP28067 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-DMAP28067 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms