Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SP100P23497 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP100P23497 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SP100P23497 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP100P23497 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP100P23497 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP100P23497 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP100P23497 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP100P23497 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP100P23497 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP100P23497 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP100P23497 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP100P23497 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP100P23497 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP100P23497 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP100P23497 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP100P23497 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP100P23497 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP100P23497 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP100P23497 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP100P23497 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP100P23497 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP100P23497 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP100P23497 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP100P23497 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP100P23497 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP100P23497 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SP100P23497 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SP100P23497 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SP100P23497 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SP100P23497 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SP100P23497 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP100P23497 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP100P23497 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP100P23497 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP100P23497 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP100P23497 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP100P23497 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP100P23497 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP100P23497 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP100P23497 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP100P23497 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP100P23497 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP100P23497 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SP100P23497 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP100P23497 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP100P23497 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP100P23497 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP100P23497 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP100P23497 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SP100P23497 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP100P23497 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP100P23497 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP100P23497 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP100P23497 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP100P23497 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP100P23497 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP100P23497 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP100P23497 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP100P23497 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP100P23497 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP100P23497 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP100P23497 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP100P23497 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP100P23497 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP100P23497 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP100P23497 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP100P23497 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP100P23497 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SP100P23497 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SP100P23497 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP100P23497 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP100P23497 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP100P23497 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP100P23497 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP100P23497 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP100P23497 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP100P23497 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP100P23497 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SP100P23497 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP100P23497 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP100P23497 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP100P23497 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP100P23497 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP100P23497 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SP100P23497 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP100P23497 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP100P23497 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SP100P23497 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP100P23497 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP100P23497 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP100P23497 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP100P23497 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP100P23497 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP100P23497 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP100P23497 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SP100P23497 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SP100P23497 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SP100P23497 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SP100P23497 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms