Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME2P22392 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME2P22392 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME2P22392 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME2P22392 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME2P22392 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME2P22392 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME2P22392 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME2P22392 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NME2P22392 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME2P22392 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME2P22392 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME2P22392 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME2P22392 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME2P22392 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME2P22392 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NME2P22392 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME2P22392 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME2P22392 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NME2P22392 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME2P22392 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME2P22392 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME2P22392 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME2P22392 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NME2P22392 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME2P22392 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME2P22392 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME2P22392 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME2P22392 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME2P22392 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME2P22392 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME2P22392 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME2P22392 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME2P22392 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME2P22392 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME2P22392 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME2P22392 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME2P22392 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME2P22392 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME2P22392 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME2P22392 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME2P22392 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME2P22392 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME2P22392 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME2P22392 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P22392 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P22392 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P22392 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P22392 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P22392 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P22392 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P22392 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P22392 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME2P22392 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME2P22392 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME2P22392 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME2P22392 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME2P22392 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME2P22392 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME2P22392 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME2P22392 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NME2P22392 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME2P22392 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME2P22392 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME2P22392 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME2P22392 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME2P22392 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME2P22392 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME2P22392 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME2P22392 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME2P22392 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NME2P22392 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME2P22392 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME2P22392 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME2P22392 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NME2P22392 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME2P22392 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME2P22392 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME2P22392 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME2P22392 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NME2P22392 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME2P22392 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME2P22392 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME2P22392 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME2P22392 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME2P22392 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME2P22392 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NME2P22392 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME2P22392 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME2P22392 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME2P22392 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME2P22392 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME2P22392 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME2P22392 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME2P22392 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NME2P22392 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME2P22392 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME2P22392 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME2P22392 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME2P22392 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms