Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRM3P20309 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRM3P20309 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRM3P20309 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRM3P20309 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms