Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNA2P20248 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA2P20248 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms