Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FCER1AP12319 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FCER1AP12319 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FCER1AP12319 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FCER1AP12319 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FCER1AP12319 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms