Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGAMP11215 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAMP11215 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms