Protein–RNA interactions for Protein: P0CW71

HSMCR30, Putative metaphase chromosome protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSMCR30P0CW71 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSMCR30P0CW71 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSMCR30P0CW71 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSMCR30P0CW71 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSMCR30P0CW71 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSMCR30P0CW71 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSMCR30P0CW71 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSMCR30P0CW71 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSMCR30P0CW71 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HSMCR30P0CW71 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSMCR30P0CW71 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSMCR30P0CW71 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms