Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBBP0CG47 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBBP0CG47 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBBP0CG47 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBBP0CG47 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBBP0CG47 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBBP0CG47 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBBP0CG47 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBBP0CG47 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
UBBP0CG47 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBBP0CG47 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBBP0CG47 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBBP0CG47 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBBP0CG47 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBBP0CG47 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBBP0CG47 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UBBP0CG47 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBBP0CG47 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBBP0CG47 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBBP0CG47 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBBP0CG47 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBBP0CG47 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBBP0CG47 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
UBBP0CG47 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBBP0CG47 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBBP0CG47 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBBP0CG47 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBBP0CG47 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBBP0CG47 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBBP0CG47 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBBP0CG47 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBBP0CG47 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBBP0CG47 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBBP0CG47 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBBP0CG47 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBBP0CG47 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBBP0CG47 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBBP0CG47 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBBP0CG47 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBBP0CG47 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBBP0CG47 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms