Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT1P04264 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT1P04264 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT1P04264 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT1P04264 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT1P04264 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT1P04264 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT1P04264 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT1P04264 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT1P04264 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT1P04264 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT1P04264 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT1P04264 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT1P04264 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT1P04264 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT1P04264 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT1P04264 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT1P04264 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT1P04264 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT1P04264 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT1P04264 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT1P04264 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT1P04264 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT1P04264 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT1P04264 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT1P04264 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT1P04264 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT1P04264 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT1P04264 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT1P04264 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT1P04264 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT1P04264 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT1P04264 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT1P04264 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT1P04264 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT1P04264 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT1P04264 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT1P04264 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT1P04264 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT1P04264 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT1P04264 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT1P04264 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT1P04264 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT1P04264 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT1P04264 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT1P04264 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT1P04264 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT1P04264 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT1P04264 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT1P04264 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT1P04264 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT1P04264 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT1P04264 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT1P04264 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT1P04264 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT1P04264 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT1P04264 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT1P04264 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT1P04264 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT1P04264 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT1P04264 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT1P04264 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT1P04264 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT1P04264 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT1P04264 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT1P04264 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT1P04264 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT1P04264 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT1P04264 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT1P04264 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT1P04264 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT1P04264 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT1P04264 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT1P04264 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT1P04264 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT1P04264 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT1P04264 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT1P04264 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT1P04264 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT1P04264 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT1P04264 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT1P04264 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT1P04264 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT1P04264 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms