Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GGPS1O95749 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GGPS1O95749 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GGPS1O95749 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms