Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATE1O95260 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATE1O95260 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATE1O95260 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATE1O95260 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATE1O95260 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATE1O95260 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATE1O95260 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATE1O95260 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATE1O95260 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATE1O95260 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATE1O95260 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATE1O95260 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATE1O95260 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATE1O95260 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATE1O95260 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATE1O95260 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATE1O95260 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATE1O95260 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATE1O95260 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATE1O95260 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATE1O95260 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATE1O95260 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATE1O95260 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATE1O95260 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATE1O95260 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATE1O95260 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATE1O95260 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATE1O95260 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATE1O95260 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATE1O95260 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATE1O95260 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATE1O95260 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATE1O95260 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATE1O95260 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATE1O95260 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATE1O95260 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATE1O95260 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATE1O95260 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATE1O95260 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATE1O95260 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATE1O95260 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATE1O95260 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATE1O95260 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATE1O95260 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATE1O95260 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATE1O95260 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATE1O95260 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATE1O95260 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATE1O95260 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATE1O95260 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATE1O95260 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATE1O95260 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATE1O95260 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATE1O95260 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATE1O95260 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATE1O95260 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATE1O95260 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATE1O95260 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATE1O95260 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATE1O95260 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATE1O95260 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATE1O95260 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATE1O95260 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATE1O95260 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATE1O95260 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATE1O95260 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATE1O95260 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATE1O95260 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATE1O95260 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATE1O95260 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATE1O95260 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATE1O95260 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATE1O95260 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATE1O95260 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATE1O95260 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATE1O95260 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATE1O95260 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATE1O95260 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATE1O95260 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATE1O95260 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATE1O95260 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATE1O95260 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATE1O95260 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATE1O95260 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATE1O95260 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATE1O95260 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATE1O95260 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATE1O95260 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATE1O95260 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATE1O95260 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATE1O95260 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATE1O95260 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATE1O95260 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATE1O95260 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATE1O95260 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATE1O95260 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATE1O95260 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATE1O95260 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATE1O95260 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms