Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL3O95164 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL3O95164 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL3O95164 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL3O95164 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL3O95164 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL3O95164 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL3O95164 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL3O95164 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL3O95164 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL3O95164 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL3O95164 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL3O95164 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL3O95164 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL3O95164 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL3O95164 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL3O95164 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL3O95164 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL3O95164 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL3O95164 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL3O95164 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL3O95164 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL3O95164 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL3O95164 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL3O95164 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL3O95164 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL3O95164 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL3O95164 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL3O95164 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL3O95164 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL3O95164 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL3O95164 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL3O95164 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL3O95164 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL3O95164 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL3O95164 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBL3O95164 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBL3O95164 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBL3O95164 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBL3O95164 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL3O95164 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL3O95164 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL3O95164 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL3O95164 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL3O95164 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL3O95164 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL3O95164 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL3O95164 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL3O95164 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL3O95164 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL3O95164 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBL3O95164 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL3O95164 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL3O95164 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL3O95164 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL3O95164 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL3O95164 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL3O95164 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBL3O95164 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL3O95164 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL3O95164 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL3O95164 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL3O95164 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBL3O95164 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL3O95164 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL3O95164 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL3O95164 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL3O95164 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBL3O95164 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBL3O95164 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBL3O95164 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBL3O95164 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBL3O95164 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBL3O95164 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBL3O95164 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBL3O95164 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBL3O95164 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBL3O95164 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBL3O95164 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBL3O95164 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBL3O95164 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL3O95164 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL3O95164 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL3O95164 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL3O95164 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL3O95164 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL3O95164 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL3O95164 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL3O95164 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL3O95164 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL3O95164 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL3O95164 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL3O95164 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL3O95164 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL3O95164 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL3O95164 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL3O95164 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBL3O95164 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBL3O95164 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBL3O95164 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms