Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP19O94966 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
USP19O94966 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
USP19O94966 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
USP19O94966 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
USP19O94966 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP19O94966 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP19O94966 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP19O94966 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP19O94966 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
USP19O94966 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
USP19O94966 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP19O94966 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP19O94966 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP19O94966 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP19O94966 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP19O94966 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP19O94966 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP19O94966 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP19O94966 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP19O94966 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
USP19O94966 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP19O94966 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP19O94966 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
USP19O94966 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP19O94966 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP19O94966 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP19O94966 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP19O94966 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP19O94966 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP19O94966 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP19O94966 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
USP19O94966 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP19O94966 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP19O94966 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
USP19O94966 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
USP19O94966 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP19O94966 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP19O94966 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP19O94966 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP19O94966 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP19O94966 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
USP19O94966 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP19O94966 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP19O94966 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP19O94966 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP19O94966 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP19O94966 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP19O94966 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP19O94966 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP19O94966 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP19O94966 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
USP19O94966 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
USP19O94966 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
USP19O94966 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
USP19O94966 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
USP19O94966 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP19O94966 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP19O94966 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP19O94966 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP19O94966 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP19O94966 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP19O94966 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP19O94966 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP19O94966 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
USP19O94966 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP19O94966 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP19O94966 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
USP19O94966 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
USP19O94966 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
USP19O94966 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
USP19O94966 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
USP19O94966 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
USP19O94966 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34■■■■□ 3.03
USP19O94966 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
USP19O94966 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
USP19O94966 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP19O94966 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP19O94966 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP19O94966 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP19O94966 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP19O94966 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP19O94966 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP19O94966 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP19O94966 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP19O94966 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP19O94966 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP19O94966 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP19O94966 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP19O94966 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP19O94966 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP19O94966 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP19O94966 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP19O94966 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
USP19O94966 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP19O94966 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP19O94966 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP19O94966 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP19O94966 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP19O94966 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms