Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP19O94966 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
USP19O94966 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
USP19O94966 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
USP19O94966 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
USP19O94966 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP19O94966 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP19O94966 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP19O94966 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP19O94966 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
USP19O94966 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
USP19O94966 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP19O94966 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP19O94966 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP19O94966 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP19O94966 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP19O94966 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP19O94966 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP19O94966 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP19O94966 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP19O94966 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
USP19O94966 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP19O94966 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP19O94966 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
USP19O94966 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP19O94966 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP19O94966 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP19O94966 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP19O94966 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP19O94966 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP19O94966 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP19O94966 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
USP19O94966 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP19O94966 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP19O94966 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
USP19O94966 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
USP19O94966 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP19O94966 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP19O94966 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP19O94966 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP19O94966 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP19O94966 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
USP19O94966 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP19O94966 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP19O94966 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP19O94966 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP19O94966 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP19O94966 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP19O94966 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP19O94966 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP19O94966 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP19O94966 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
USP19O94966 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
USP19O94966 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
USP19O94966 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
USP19O94966 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
USP19O94966 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP19O94966 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP19O94966 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP19O94966 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP19O94966 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP19O94966 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP19O94966 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP19O94966 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP19O94966 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
USP19O94966 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP19O94966 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP19O94966 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
USP19O94966 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
USP19O94966 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
USP19O94966 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
USP19O94966 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
USP19O94966 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
USP19O94966 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34■■■■□ 3.03
USP19O94966 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
USP19O94966 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
USP19O94966 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP19O94966 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP19O94966 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP19O94966 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP19O94966 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP19O94966 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP19O94966 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP19O94966 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP19O94966 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP19O94966 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP19O94966 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP19O94966 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP19O94966 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP19O94966 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP19O94966 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP19O94966 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP19O94966 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP19O94966 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
USP19O94966 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP19O94966 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP19O94966 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP19O94966 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP19O94966 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP19O94966 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms